Samme år opnåede han speciallægeanerkendelse i kirurgi og i 1999 i kirurgisk gastroenterologi.
Anders Bak-Christensen er forfatter til en række videnskabelige publikationer og deltager løbende i kurser og kongresser.
Anders Bak-Christensen har været næstformand for Foreningen af Praktiserende Speciallæger (FAPS) og medlem af bestyrelsen i Foreningen af Speciallæger (FAS).
Herudover har han været formand for DSAK (Dansk Selskab for Ambulant Kirurgi og Gastroenterologi) og næstformand for DKO (Danske Kirurgers Organisation) og medlem af bestyrelsen i FAS´s Sygefond.
Anders Bak-Christensen har stor rutine i endoskopiske undersøgelser (kikkerundersøgelse af mavesæk, ende- og tyktarm), hæmorrhoidebehandling, brokoperationer, åreknudeoperationer, operation for forhudsforsnævring, nedgroet negl, mandlig sterilisation samt diverse andre kirurgiske indgreb.